Nach der Ausbildung spielte er u. a. in Theaterstücken wie „Warten auf Godot“, „Ein Sommernachtstraum“, „Caligula“, „Die Physiker“ und „West Side Story“.
Er spielte am Prinzregententheater in München den „Meister“ in der Uraufführung von „Krabat“ von Otfried Preußler und eröffnete zusammen mit Susanne Brantl die Studiobühne des Staatstheaters am Gärtnerplatz in München („Zerwirkgewölbe“) mit dem, zum musikalischen Theaterstück ausgearbeiteten Liederabend Mitternachtslieder von Wilfried Hiller und Michael Ende.
Er schrieb und spielte mehrere Kabarettprogramme und arbeitete auch als Theater-Regisseur.
TV-Filmen, darunter auch Gastrollen in der TV-Serie Der Bulle von Tölz. Einem großen Publikum wurde Joseph Hannesschläger durch die Rolle als Kriminalhauptkommissar und Landwirt Korbinian Hofer in der Serie Die Rosenheim-Cops bekannt (bisher über 450 Folgen und vier TV-Filme).
Im Kino spielte Hannesschläger in Der Schuh des Manitu (Rolle Barmann), Nur über meine Leiche, Bandits, Die Apothekerin, Poppitz, Harte Jungs und in Knallharte Jungs, Mara und der Feuerbringer und Schmucklos- Der Film Als Musiker ist er mit seiner Showband Discotrain aktiv.
Im Juni 2011 veröffentlichte er die CD „München im Sommer“ bei Sony Music. Circa 50 % der Musik und 75 % der Texte stammten aus seiner eigenen Feder.
Sozial engagiert sich Hannesschläger u. a. für die Aktion Weihnachten im Schuhkarton des Vereins Geschenke der Hoffnung, die er 2015 im Rahmen einer Kampagne mit weiteren Prominenten unterstützte.
Ebenso für die Christiane Herzog Stiftung für Mukoviszidose-Kranke.
2018 war er für die Romy nominiert in der Kategorie „Beliebtester Schauspieler",
2019 war zusammen mit seinen Kollegen für die Goldene Kamera in der Kategorie „Beliebteste Heimatserie“ nominiert.
Im Sommer 2018 heiratete er seine Lebensgefährtin, die Münchnerin Bettina Geyer